Сидихин сыграл боксера Виктора в боевике Николая Стамбула «За последней чертой» в 1991 году, вместе с певцом Игорем Тальковым. В фильме главный герой, которого играет Евгений, выходит на свободу после отбытия трехлетнего срока заключения после избиения человека, чем привлек внимание преступников, которые занимаются угрозами и рэкетом. Игорь играет роль их лидера. По сценарию Эдуарда Володарского, герой Сиддихина убивает героя Талькова двумя выстрелами с близкого расстояния. Эта интермедия напоминает сцену трагической смерти Туркова, известную как пророчество, которая происходит ровно через год в реальной жизни.
Следующий проект Сидихина состоялся в 1999 году. Совместное российско-германское кинопроизводство «Барак» получило ряд наград, включая Государственную премию Российской Федерации, Гран-при фестиваля «Окно в Европу» и Специальный приз жюри Международного кинофестиваля в Локарно (Швейцария). Фильм рассказывает о событиях в России в переломные годы после смерти Сталина. В фильме Сидихин играет роль Болотина, сотрудника областной полиции.
В 2000 году вышел полицейский сериал «Бандитский Петербург», в котором рассказывалось о столкновениях между преступными группировками на севере России. Роль сыщика Кудасова сделала его популярной звездой. Многие коллеги Сидихина, включая Алексея Серебрякова и Александра Домогарова, также участвовали в проекте, который после выхода получил необычный прием.
В 2002 году Сидихин снялся в криминальном триллере «Антикиллер» с Гошей Куценко и Сергеем Шакуровым, где Евгению досталась роль безжалостного бандита по прозвищу «Баркас». Чтобы сделать роль более человечной, режиссер Егор Кончаловский решил включить в фильм 14-летнюю дочь Евгения, Полину.
В 2013 году актер снялся в роли подполковника Демидова в криминальном сериале «В зоне риска». Согласно сюжету, команда во главе с главным героем, которого играет Сидихин, ищет сбежавшего преступника. Режиссер Владимир Котт признался после съемок, что был впечатлен способностями Сидихина. 49-летний актер сам выполнял все трюки в фильме.
Зарубежный кинематограф
В 2016 году он сыграл преступника-беглеца Алексея в кинофильме Саффи Неббу во французском фильме «В лесах Сибири», основанном на одноименной автобиографии Сильвена Тессона. Он встречает Тедди (Рафаэль Перссонас), французского отшельника, заблудившегося в снежной буре на озере Байкал. Эта встреча меняет их обоих.
Евгений пытается изменить свою карьеру различными способами. Он отказывается от роли, на которые пробовался ранее. К счастью, Сидихин, что необычно для его карьеры, находит режиссера, который видит в нем потенциал для драмы и других ролей.
Однако Сидихин не оставил привычный жанр боевика навсегда. После долгого перерыва он снялся в фильме «Антикиллер» вместе со своей дочерью, Мариной Порошиной и Михаилом Ефремовым. Евгений часто играл в зарубежных фильмах. У него была возможность работать с режиссерами, работающими за рубежом, такими как Рустем Абдрашев, Саффи Неь, Максим Литвинов и Флориан Хенкель фон Доннерсмарк.